Rotamerler, büyük moleküllerin yan zincirlerinin en kararli, en düsük enerjili konformasyonlarina verilen isimdir. Moleküler modelleme yaparken, vakitten kazanim yapmak ve amerikayi tekrar kesfetmemek icin önceden hesaplanmis ve bilinen rotamerlerden olusan bilgi bankalari, kütüphaneler kullanilir.

Bircok farkli moleküllün rotamerlerine günümüzde ulasmak oldukca mümkün. Ama elbette ki rotamerleri hakkinda fazla bilgi bulunmayan yapilar da mevcut.